Have you restarted Ajenti after installing MySQL?

Да, такой набор плагинов (для виртуального хостинга) сейчас в разработке.

Мне жаль, но доля Arch среди пользователей ajenti 0.6.x была слишком мала, а усилий для его поддержки требовалось слишком много.

But which user did you login as after that?

It's already in the FAQ http://docs.ajenti.org/man/faq.html#i-forgot-my-password

Fedora не является поддерживаемой платформой, но можно поставить: pip install ajenti

Yes, you should be able to configure Samba 4