Vos commentaires

Just in case, I released an update which fixes /var/lib/csf not being found if you have never run csf after installation.
Where is your csf.conf located? Which OS are you using?
No, currently there's no plugin for dnsmasq, but there's a plugin for ISC DHCPD, a more full-blown DHCP server.
Скорее всего у вас конфликтуют пакеты php5-fpm и php5-cgi, и установка CGI удалила FPM.
Этот мануал для Debian - лучше возьмите нормальный: http://support.ajenti.org/topic/349868-installing-on-ubuntu/
Убедитесь, что между вами и репозиторием нет, например, кеширующего прокси. Версия в репозитории - 1.2.19.3
Run apt-get update